한의원 세무사
원장님은 진료에만,
세금은 저희가 챙깁니다
한의원 세무는 공단 청구와 자동차보험, 비급여 한약 수입, 인건비와 한약재 원가가 한꺼번에 움직입니다. 매월 급여 원천세, 2월 사업장현황신고, 5월 종합소득세까지 대표세무사가 1년 일정을 직접 챙기고, 전국 한의원을 비대면으로 맡아 드립니다.
한의원 세무, 여섯 가지를 함께 봅니다
신고서 몇 장이 아니라 한의원 운영의 1년 일정을 함께 관리합니다.
한의원 세금, 지금 바로 계산해 보세요
한 해 수입과 경비로 종합소득세를, 페이닥터 세후 월급으로 세전 월급과 원장님 부담을 계산합니다.
경비 칸을 직접 고치기 전까지는 수입금액에 맞춰 인건비 30%, 임차료 9%, 한약재·재료비 15%, 기타 12%로 채워 둡니다.
그해 수입금액이 5억원 이상이면 성실신고확인 대상이라 6월 30일까지, 그 밖에는 5월 31일까지 신고하고 냅니다.
- 연 수입금액
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- 필요경비
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- 사업소득금액
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- 소득공제
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- 과세표준
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- 산출세액
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- 연금계좌 세액공제
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- 표준세액공제 (성실사업자)
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- 지방소득세 (10%)
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- 세금 내고 남는 소득
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2026년 10월 현행 세율(6~45%)로 계산한 추정치입니다. 인적공제는 1명당 150만원, 노란우산공제는 사업소득금액에 따른 한도(600만~200만원), 연금계좌는 연 900만원 한도와 공제율(종합소득금액 4,500만원 초과 12%, 이하 15%), 성실사업자 표준세액공제 12만원(카드·현금영수증 가맹, 장부 신고, 사업용계좌 사용)을 반영했습니다. 한의원은 전문직 사업자라 복식부기의무자이고 기장세액공제는 없습니다. 공단·보험회사가 원천징수한 세금(3%), 중간예납, 성실신고확인비용과 고용 관련 세액공제, 자녀세액공제, 다른 소득은 반영하지 않았습니다.
매달 떼는 소득세는 간이세액표를 따르고, 1년 세금은 다음 해 2월 연말정산에서 확정됩니다. 지급명세서는 3월 10일까지 냅니다.
| 월 기준 | 금액 |
|---|---|
| 페이닥터가 받는 금액 (Net) | - |
| 근로소득세 + 지방소득세1년 정산액의 1/12 | - |
| 4대보험 페이닥터 몫 | - |
| 세전 월급 | - |
| 4대보험 원장 몫 | - |
| 퇴직금 적립 (1/12) | - |
2026년 요율로 계산한 추정치입니다. 1년 내내 같은 월급을 받고 본인 공제만 받는다고 보고 연말정산 결정세액으로 계산했습니다. 국민연금 9.5%(각 4.75%, 2026년 7월부터 적용되는 기준소득월액 41만~659만원으로 1년 단순 계산), 건강보험 7.19%(각 3.595%), 장기요양 0.9448%(건강보험료의 13.14%, 각 절반), 고용보험 근로자 0.9%·사업주 1.15%(150인 미만), 산재보험 0.66%(사업주 부담)를 적용했습니다. 부양가족이나 다른 소득이 있으면 결과가 달라집니다.
첫 상담은 무료로 시작합니다
지금까지 어떻게 신고해 왔는지부터 듣고, 놓친 신고와 줄일 수 있는 세금을 먼저 짚어 드립니다.
한의원 형태와 수입 규모, 페이닥터·직원 구성, 자동차보험 진료 비중, 지난해 신고서를 함께 보고 앞으로 1년의 신고 일정과 세금을 정리해 드립니다.
상담 신청하기신고 일정까지 한 번에
공단·보험회사 지급 내역과 카드·현금 수입, 한약재·탕전 비용 같은 경비를 매달 정리하고, 급여 원천세와 2월 사업장현황신고, 5월 종합소득세 신고까지 이어서 맡습니다. 건강기능식품 판매 같은 과세 매출이 있으면 1월·7월 부가세 신고도 함께 합니다.
- STEP 01무료 상담전화, 카카오톡, 아래 신청서
- STEP 02자료 연결홈택스 수임 동의, 카드·통장 자료
- STEP 03매월 관리장부, 급여 원천세, 4대보험
- STEP 04신고2월 사업장현황, 5월 종합소득세
상담 전에 지난해 종합소득세 신고서와 페이닥터·직원 명단(급여 주는 방식)을 준비해 주시면 더 정확하게 봐 드립니다.
왜 위너인가?
"한의원은 공단 청구와 자동차보험, 비급여 한약 수입이 함께 들어오고, 인건비와 한약재 원가가 큰 경비입니다.
그 흐름을 정확히 맞추는 일부터 대표세무사가 직접 챙깁니다."
한의원 원장님이
가장 먼저 확인할 것
상담을 시작하면 많은 원장님이 이렇게 먼저 물으십니다.
진료 대부분은 면세지만, 실제 세금은 아래 네 가지에서 크게 달라집니다.
비급여 현금·계좌이체를 모두 잡고 있는가
한 번에 10만원 이상을 현금이나 이체로 받고 현금영수증을 발급하지 않으면 그 금액의 20%가 가산세이고, 수입을 적게 신고하면 사업장현황신고 가산세 0.5%도 붙습니다.
자동차보험 진료비를 따로 맞추고 있는가
자동차보험 진료비는 보험회사가 심사 결과에 따라 지급해 청구액과 입금액이 달라질 수 있습니다. 12월 진료분처럼 해를 넘겨 받는 진료비도 그해 수입이라 미수금으로 정리해야 합니다.
한약재 매입과 재고를 장부에 맞추고 있는가
한약재는 그해 쓴 만큼만 원가가 됩니다. 매입 계산서와 연말 재고 목록이 맞아야 원가가 정확하고, 의료업자 수입금액검토표의 의약품·재료 수불과도 이어집니다.
페이닥터를 Net으로 계약했는가
세후 금액으로 계약해도 원천징수와 4대보험, 퇴직금은 세전 월급으로 계산합니다. 연말정산 환급금을 누가 가져가는지도 계약서에 적어야 합니다.
위너가 한의원 세무를 관리하는 방식
한 번 신고하고 끝나는 일이 아니라 1년 내내 이어지는 일정입니다.
대표세무사가 자료 연결부터 신고까지 직접 챙깁니다.
한의원 세무 1년 일정을 함께 관리합니다
홈택스 수임 동의와 카드·통장 자료를 연결하고, 공단·보험회사 지급 내역과 수납 합계를 매달 받습니다.
직원·페이닥터 급여 원천세(다음 달 10일)와 4대보험 변동, 한약재·탕전 비용 증빙을 챙깁니다.
과세 매출이 있으면 1월에 부가세를, 2월 10일까지 의료업자 수입금액검토표와 사업장현황신고를 합니다.
장부로 경비를 빠짐없이 반영해 신고하고, 수입 5억원 이상이면 성실신고확인까지 6월에 마칩니다.
한의원 세무 검토 사례
비슷해 보여도 한의원마다 확인할 순서가 다릅니다.
세후 월 600만원으로 계약했을 때
세전 월급을 역산해 급여 신고와 4대보험을 맞추고, 원장님 월 부담과 연말정산 정산 주체를 계약서에 정리합니다.
인테리어와 장비에 1억 7,000만원을 쓰고 문을 연 첫해
면세 진료라 부가세를 돌려받지 못해 부가세를 포함한 금액을 5년 안팎에 나눠 감가상각하고, 개원 대출 이자와 처음 들여놓은 한약재 재고도 장부에 정리합니다.
12월 진료분이 해를 넘겨 들어온 해
진료한 해의 수입으로 미수금에 잡고, 보험회사별 지급 내역과 심사 조정 내역을 장부와 맞춰 2월 신고와 5월 신고에 반영합니다.
권리금을 주고 한의원을 넘겨받을 때
영업권 대가는 넘기는 원장님의 기타소득이라 인수하는 쪽이 8.8%를 원천징수하고, 영업권은 5년, 장비는 내용연수에 나눠 비용으로 넣습니다.
상담에서 자주 만나는 유형을 정리한 것이며, 실제 세액은 한의원 규모와 계약 내용에 따라 달라집니다.
전국 어디서나
지역별·주제별 한의원 세무 상담
전국 한의원을 비대면 기장으로 맡고, 수도권은 광교 사무실 방문 상담도 합니다.
시·도와 시·군·구, 주제마다 원장님들이 자주 묻는 세무 질문을 사례로 정리했습니다.
7월 개원 한의원, 인테리어 1억 1,600만원과 장비 4,500만원 감가상각을 넣은 첫해 세금
개원 첫해 비용 처리 →02수원 영통 · 용인 수지 일부광교 한의원 세무수입 3억 1,600만원 한의원, 장부 신고 871만원과 추계 신고 3,943만원
장부와 추계 비교 →03화성시 동탄동탄 한의원 세무1년 수입 5억 2,900만원 한의원, 결제수단별 수입 구성과 누락 시 가산세
2월 수입금액 신고 →04성남시 분당구분당 한의원 세무영업권 대가 1억 100만원, 기타소득 합산으로 늘어나는 세금 1,689만원
한의원 양도와 권리금 →05용인 수지 · 기흥 · 처인용인 한의원 세무12월 한약재 3,100만원 추가 매입, 기말 재고를 빼면 원가와 세금은 그대로
한약재 재고와 원가 →06서울 강남구강남구 한의원 세무권리금 1억 1,300만원 한의원 인수, 영업권 7,100만원 원천징수와 5년 상각
한의원 인수와 권리금 →07서울 서초구서초구 한의원 세무소득 1억 7,000만원 원장님, 노란우산 700만원과 연금계좌 900만원 납입으로 줄어드는 세금 203만원
공제 한도와 절세 →08서울 송파구송파구 한의원 세무1년 수입 3억 7,930만원 한의원, 결제수단별 수입 구성과 누락 시 가산세
2월 수입금액 신고 →한의원 원장님이
자주 묻는 세금 문제
상담에서 자주 받는 질문을 주제별로 정리했습니다.
지금 상황과 가까운 안내부터 읽어 보세요.
개설 신고부터 사업자등록, 첫해 장부와 신고 일정
한의원 개원 세무 안내 →한의원 기장복식부기 장부와 한약재 증빙, 월별 결산
한의원 기장 안내 →한의원 종합소득세5월 신고, 경비 반영과 공단 원천징수 세액
한의원 종합소득세 안내 →한의원 성실신고수입 5억원부터 6월 30일 신고, 확인 준비와 가산세
한의원 성실신고 안내 →한의원 사업장현황신고2월 10일 수입금액 신고와 의료업자 수입금액검토표
한의원 사업장현황신고 안내 →한의원 자동차보험 진료비자동차보험 진료비 수입 구분과 원천징수 세액 정리
한의원 자동차보험 진료비 안내 →한의원 부가세건강기능식품 판매 같은 과세 매출과 겸영 신고
한의원 부가세 안내 →페이닥터 급여와 세금Net 계약 세전 역산, 원천징수와 4대보험
페이닥터 급여와 세금 안내 →한의원 직원 4대보험2026년 요율과 원장 부담, 두루누리 지원
한의원 직원 4대보험 안내 →한의원 공동개원동업계약서와 손익분배, 원장별 신고
한의원 공동개원 안내 →한의원 양도양수권리금 원천징수와 영업권 상각, 폐업 신고
한의원 양도양수 안내 →한의원 절세노란우산·연금계좌, 고용세액공제와 경비 관리
한의원 절세 안내 →한의원 세무 자주 묻는 질문
한의원 진료와 한약에도 부가세가 붙나요?
침·뜸·부항, 추나요법 같은 진료와 한의사가 진찰한 뒤 처방·조제하는 한약은 의료보건용역이라 부가세가 면제됩니다. 다만 진료와 별개로 파는 건강기능식품이나 한방 화장품 같은 상품은 과세되고, 요양급여 대상이 아닌 미용 목적 시술도 부가가치세법 시행령에 열거된 것(성형수술, 피부미백술 등)에 실제로 해당하면 과세되어, 이런 매출이 있는 한의원은 1월과 7월에 부가세를 신고합니다.
사업장현황신고를 안 하면 가산세가 있나요?
네. 의료업은 다음 해 2월 10일까지 사업장현황신고를 하지 않거나 수입금액을 적게 신고하면 그 금액의 0.5%가 가산세입니다. 이 가산세는 면세업종 가운데 의료업·수의업·약사업에만 적용되고, 신고 때 의료업자 수입금액검토표를 함께 냅니다.
한의원도 복식부기 장부를 써야 하나요?
네. 의료업은 전문직 사업자라 수입 규모와 관계없이 개원 첫해부터 복식부기의무자입니다. 장부 없이 추계로 신고하면 단순경비율을 쓸 수 없고 기준경비율의 절반만 인정되며 가산세가 붙습니다.
자동차보험 진료비는 어떻게 정리하나요?
자동차보험 진료비는 건강보험심사평가원 심사를 거쳐 보험회사가 지급합니다. 장부와 의료업자 수입금액검토표에서 건강보험 수입과 따로 적고, 12월 진료분처럼 해를 넘겨 받는 진료비도 진료한 해의 수입으로 미수금에 잡습니다.
페이닥터 급여는 어떻게 처리하나요?
진료 시간과 장소를 한의원이 정하고 고정급을 주는 페이닥터는 근로자로 보는 것이 일반적이라 근로소득으로 원천징수하고 4대보험에 가입합니다. 세후 금액으로 계약했다면 세전 월급으로 바꿔 급여 신고와 4대보험, 퇴직금을 계산합니다.
현금이나 계좌이체로 받은 한약값은 어떻게 하나요?
한의원은 현금영수증 의무발행업종이라 한 번에 10만원 이상을 현금이나 계좌이체로 받으면 환자가 요청하지 않아도 현금영수증을 발급해야 합니다. 발급하지 않은 금액의 20%가 가산세이고(건강보험·의료급여 급여 대상 금액은 제외), 환자 정보를 모르더라도 받은 날부터 5일 안에 국세청 지정번호(010-000-1234)로 발급해야 합니다.
성실신고확인은 언제 받나요?
보건업은 그해 수입금액이 5억원 이상이면 성실신고확인 대상입니다. 세무사의 확인을 받아 6월 30일까지 신고하고, 확인비용의 60%(최대 120만원)를 세액공제받습니다. 확인서를 내지 않으면 가산세가 붙습니다.
연말에 한약재를 많이 사 두면 세금이 줄어드나요?
한약재는 그해 쓴 만큼만 원가가 되고, 남은 재고는 기말 재고로 빼서 다음 해 원가로 넘어갑니다. 12월에 몰아 사도 그해 세금은 거의 달라지지 않으니 처방량과 보관 기간에 맞춰 사는 편이 낫습니다.
한의원을 인수할 때 권리금은 어떻게 처리하나요?
권리금을 장비·인테리어 대가와 영업권 대가로 나눠 적습니다. 영업권 대가는 넘기는 원장님의 기타소득이라 지급할 때 8.8%를 원천징수하고, 인수한 쪽은 5년에 나눠 비용으로 넣습니다. 장비 대가는 유형자산으로 감가상각합니다.
한의원을 법인으로 바꾸면 세금이 줄어드나요?
주식회사 같은 영리법인은 의료기관을 개설할 수 없어 일반 사업처럼 법인전환을 할 수 없습니다. 개인 한의원 안에서 경비를 빠짐없이 넣고 노란우산공제, 연금계좌, 고용 관련 세액공제를 챙기는 것이 기본입니다.
서울이나 지방 한의원도 맡길 수 있나요?
네. 홈택스 수임 동의로 카드·현금영수증·세금계산서 자료를 받고, 급여와 공단 지급 내역은 메일이나 카카오톡으로 받기 때문에 지역과 관계없이 비대면으로 기장과 신고를 맡기실 수 있습니다. 방문 상담은 광교 사무실에서 합니다.
상담료가 있나요?
첫 상담은 무료이고, 기장료는 상담 때 견적으로 먼저 안내해 드립니다.
1분이면 충분합니다, 한의원 세무 상담 신청
신고 일정이 다가오기 전에 먼저 점검해 보세요.
대표세무사가 확인 후 직접 연락드립니다.
한의원 원장님의 기장과 사업장현황신고, 종합소득세 신고를 함께 관리하고 있습니다. 법령과 요율은 2026년 10월 기준이며 최종 검토일은 2026.10.20입니다.
